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10月18日，中共中央政治局常委、国务院副总理李克强在主持营改增试点工作座谈会时，强调要以营改增为重要抓手，促进产业结构升级，加快服务业和中小企业发展。并指出，要认真总结试点经验，有序扩大试点范围。
按照国务院通过的试点时间表，上海、北京、江苏、安徽都已经陆续开展营改增试点，11月1日福建省、广东省也将加入试点行列，天津市、浙江省、湖北省将在12月1日开始试点。而未纳入试点范围的省份，如四川也在积极进行前期调研，希望能在明年尽快加入试点。
营改增有关试点行业、税率、免税政策、税收划分、政策的衔接、发票等重大问题，都由中央文件进行明确规定；但对于税负增加的企业，如何进行补贴，并没有统一安排。就目前试点情况来看，现代服务业企业的税负基本有所减轻，惟独部分交通运输企业存在税负增加的问题。
今年要陆续进行试点的各省市，正在紧锣密鼓地制定各项具体政策。对于财政补贴这块，有些省市给出了明确的补贴方案，有些省市则只作了原则性的规定。
制定补贴比例，防止骗税
深圳市物流协会秘书长郑艳玲曾表示，如果财政补贴不到位，深圳几万家中小物流企业将面临生存危机。某中小物流企业主对未来补贴政策是否能保证公平表示担忧，他在接受记者采访时表示，从上海的经验来看，财政补贴更多向大企业倾斜，中小企业可能会“靠边站”。
国家层面出台的《营业税改征增值税试点方案》中，对税改目标进行了概括性的描述，保证“改革试点行业总体税负不增加或略有下降”。
上海公开的口径是“确保试点行业和企业税负基本不增加”，具体流程是“企业据实申请、财政分类扶持、资金及时预拨”，操作方法是企业按月报告，财政部门“按月跟踪分析、按季审核预拨、按年据实清算”。这是上海2月份公布的方案，为原则性规定。
在实务层面，早期有上海企业反映，由于税制转换，增值税和营业税不具备完全意义上的可比性，因此对于税负增加多少，存在企业和财政部门“公说公有理，婆说婆有理”，存在拉锯战、扯皮的现象。
据上海财经大学教授胡怡建介绍，上海现在已经出台具体补贴方案，标准大致是企业税负累计超过3万元，由财政部门补贴70%，在年底再进行清算。
现在从各省市公开的政策来看，几乎所有省市都提到会有“过渡性财政政策”进行配套。
北京方面，要求试点企业填写税负变化表，企业需要填写的数据有三类，分别是“按试点政策规定计算缴纳的增值税”“按原营业税规定计算应缴纳的营业税”和“上年同期营业税”。
北京也是按季度受理企业申请，且财政扶持资金的下拨，需要经过市级财政部门的审批；对于企业申请扶持资金金额较少的，财政部门可在年度清算后拨付；要求在全年结束的3个月之内，进行清算，多退少补。
据记者了解，北京现在尚未公开补贴细则，由于北京9月1日试点，增值税一般按季度进行清算，今年只剩下最后一个季度，对于今年的补贴，可能也要到明年才能到位。财政补贴资金也是类似上海，按比例补贴，这个比例的确定，结合了数据模型和实践经验。之所以不全额补贴，在于避免有些企业进行税收筹划，骗取财政补贴。
中翰税务合伙人王骏指出，企业税负增加，有可能是税制结构的原因，也可能是因为企业本身业务的增长，依据企业填写税负变动表，与上年同期税负进行比较，再依据数据模型，能比较合理地评估企业税负增加情况。
试点结束再清算
江苏方面，目前也只出台一个原则性的规定，“对企业增负要分析原因，分类处理。对确因改革增负的企业，可根据企业申请，财税部门核实后，根据实际情况对其实施财政专项资金等财政扶持政策”。
不过，江苏还指出，各市县财税部门制定的增负处理办法要“报省级财税部门备案，并向社会公开”，各省辖市、县之间要加强沟通和协调，妥善处理增负问题，“避免地区间政策差别过大”。现在积极备战的省市，多类似江苏，只是出台大原则，未制定实施细则。厦门的政策，则要清晰得多。
厦门试点企业除了要填写税负变动表，并提供其他材料，还对财政拨付流程、具体标准进行了详细规定——在一定期限内税负升高累计超过3万元，可向财政部门提出预拨财政扶持资金的申请，财政部门审核确定后，按企业累计升高税负的70%预拨给企业；企业无需每个月都提交申请，而是当税负升高累计较多时再申请。
厦门除了进行年度清算外，还新增了“政策期满后统一清算”这一流程，即当营改增在全国全面实施、该过渡财政扶持政策执行期满后，财政部门将对已申请并取得财政扶持资金的试点企业进行统一清算，多退少补。
王骏指出，厦门这一做法比较公平，因为税负的变化不是体现在一两个月内，而是一个长期过程。如果当月企业没什么进项，当月税负可能会有急剧上升。在过渡政策终了时，再进行清算，能保证财政部门和企业都不吃亏。
不过，若仍制定一个预拨门槛，貌似仍会存在前述中小企业对补贴不公平的担忧。毕马威华南区税务合伙人李雁指出，各地财政补贴标准主要依据当地财政承担能力而定，要求全国有统一的标准不大可能。通常而言，各地会依据“重要性原则”，只有当营改增影响的税负确实增加，对企业经营产生影响时进行财政扶持，这也是政府实现改革目标的一个对策。
胡怡建进一步指出，财政补贴只是一个过渡政策，不是长久之计。因为交通运输部分企业税负增加的情况，在未来即便营改增全面推开后，可能这部分企业的税负仍不能有效减轻。未来只有通过增加交通运输企业的抵扣项目，如纳入过桥过路费等，才能切实减轻企业税负。
不过，李雁认为，部分交通运输企业税负增加可能也只是暂时的，这些企业由于在试点前购进了设备，导致抵扣项少；但未来这些运输企业会就设备进行维修，或者更换，这就能为企业带来大量进项。
中国社会科学院财经战略研究院研究员张斌，曾对营改增部分试点企业进行调研。张斌指出，部分企业税负增加，可能是企业在缴纳营业税时，存在偷漏税现象。因为若比较企业营业税应缴纳税额，和改为增值税后应缴纳增值税，若企业进行营改增，是减税的。之所以出现税负增加的问题，在于增值税在征管和缴纳环节，要比营业税规范得多，按增值税缴税，企业逃避税款的空间减少了。
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